在 PKI 的使用領域中，憑證及對應的公、私金鑰組，是 PKI 各項運用的主要核心，透過金鑰的使用，可以達到簽章及加密的功能；輔以憑證的檢驗機制，可以達到身分確認的效果。在電子化的各項應用裡，無論是安全方面的用途，或是節省人力成本的目的，PKI 的機制都能夠在其中佔有一席之地。
X509 憑證的發布及申請
憑證代表著某一組公、私金鑰的身分識別，是由一個發布中心 CA（Certificate authority）所發行，由於 PKI 的身分識別及不可否認性，所以通常由具有公信力的第三方機構來架設 CA，例如內政部自然人憑證管理中心 MOICA，而 MOICA 所發布的個人憑證，其憑證與公、私金鑰就能夠代表某一位國民的身份，進而能夠進行一連串的個人電子化應用。
通常使用者要向 CA 取得一張憑證，並非直接取得，而是透過一個平台稱為 RA（Registration authority）來進行申請，如同到郵局申辦業務時，是透過櫃台人員進行流程作業，然後櫃台人員再使用背後的資源完成作業需求，而 RA 的角色就如同櫃台一樣。所以一個使用者想要申請一張憑證，也需要透過 RA，來向 CA 申請一張憑證，RA 就像是一個註冊中心，管理所有前來註冊的申請人，RA 可以進一步事先審核申請人的資料及合法性，確認申請人的身分是否正確，然後 RA 再向 CA 提出憑證的申請。
透過憑證註冊系統 RA 申請憑證
RA 多數設計成網頁介面，方便使用者連接上網路進行申請，申請過程中會依序進行以下步驟：
- 使用者輸入申請資料，或由 RA 管理人員進行填寫，先進行一次身分審核。
- RA 會在使用者端的載具上（例如電腦本身或是 IC 卡），產製一組使用者的公、私金鑰組。
- 將使用者私鑰保留在載具內、再將公鑰連同使用者資料，計算出一組申請用的編碼（Request Code），送往 CA 進行憑證申請。
- CA 收到 Request Code 後，就會簽發出一張憑證交還給 RA。
- RA 收到憑證後，將公、私金鑰組及憑證在使用者端載具內進行合併，完成申請手續。
RA 除了提供一個讓使用者能夠進行憑證申請的平台外，最主要的功能在於，RA 可以統計所有前來申請的申請人憑證及資料，進一步提供使用者日後對於展延、廢止或重新申請憑證的需求。RA 也能夠得知已申請的憑證目前狀態，進一步提供與使用者的互動。
了解 RA 的定位後，可以進一步對 RA 的架構進行規劃，從 RA 如何取得、審核申請人資料，到如何管理已申請的所有憑證，都可以配合各家廠商現有的系統進行整合。例如以下常見架構：
- 以特定數名管理者 RAO（Registration authority officer），來進行申請人的資料審核及填寫，申請完成後，再將帶有公、私金鑰及憑證的 IC 卡或軟體憑證（PFX）交給申請人，如內政部自然人憑證的申請流程。
- 開放使用者自行登入 RA 進行申請，此時 RA 會設計一套驗證使用者的方式，來驗證申請人的身分，然後進一步取得申請人的申請資料，例如部分的銀行業者會採用此種架構來建立銀行軟體憑證。
- RA 開放網路服務（Web Service）進行各種載具的憑證申請，經過身分驗證後，可讓手機平台或平板電腦等行動裝置，能夠向 RA 進行憑證申請動作。
